Software pro mikrobiologii

Kromě mikroskopů a Petriho misek jsou počítače důležitým nástrojem pro mikrobiology. Software pro výzkum mikrobiologie zahrnuje nástroje používané jinými vědeckými a inženýrskými obory, jakož i specializované aplikace pro studium bakterií a jiných mikroorganismů. Mnoho aplikací vyvinutých vládními agenturami, neziskovými nadacemi nebo akademickými výzkumnými pracovníky je k dispozici jako bezplatný software ke stažení a používání, jak vyžaduje váš experiment nebo laboratoř.

Nástroje vizualizace
Fyzický nebo duševní obraz nezpracovaná data, která shromažďujete, vám mohou pomoci lépe pochopit jeho kvalitu, význam a důsledky. Pro mikrobiologický výzkum je široce dostupný open source a komerční software pro vizualizaci dat. Vytvořte grafy a grafy vašich dat pomocí LibreOffice Calc, Microsoft Excelu nebo systému pro vizualizaci dat Mondrian. Aplikace Cell-O a RasMol vám pomohou vytvořit 2D a 3D animované modely biologicky významných molekul, jako jsou proteiny a aminokyseliny.

Matematické modelování
Velké sbírky mikrobiologických dat často přinášejí smysluplnější informace, jakmile mají byly numericky analyzovány. Softwarové balíčky MATLAB, Octave a SciPy, které provádějí matematické zjemnění, analýzu a modelování údajů vědců. Pomocí těchto balíčků proveďte odhad parametrů pomocí přizpůsobení křivek, epidemiologických predikcí, simulací růstu bakterií a eliminace šumu dat nebo stochastického efektu. Tato aplikace také provádí statistické výpočty, jako je analýza rozptylu nebo Chi-square testů.

Bioinformatika genomu
Mikrobiologické softwarové aplikace také pomáhají při vizualizaci a důlních informacích ze sekvence nukleových kyselin, které tvoří mikroorganismy. DNA organismu. Nadace Open Bioinformatics Foundation poskytuje bezplatné, open-source DNA sekvenční a analytické aplikace jako BioJava a Biopython, které extrahují data z informačních bank genomu, analyzují kód DNA organismu a porovnávají je s jinými vzorky DNA. Další balíčky analýzy genomu zahrnují Emboss, HMMER, Clustal Omega, Fylogeny Inference Package, nebo PHYLIP, a Sequence Manipulation Suite, nebo SMS.

Referenční software
Rychlé tempo vědeckého objevu v mikrobiologii a měnící se vlády Je nezbytné, aby mikrobiologové měli rychlý přístup k informacím, které ovlivňují jejich práci. HUGO je komerční softwarový balíček, který poskytuje mikrobiologům aktuální informace o nástrojích, chemikáliích, vybavení, kultivačních médiích, požadavcích na bezpečnost, nových organismech, taxonomických změnách a antibiotikách. Kromě toho mohou mikrobiologové pracující v potravinářství používat webovou aplikaci ComBase Browser pro přístup k mikrobiologickým datům souvisejícím s potravinami poskytovaných vládními agenturami ve Spojeném království, Austrálii a Spojených státech.
URL:https://cs.whycomputer.com/Internet/100108339.html